OUR APPROACH
기술 플랫폼.
설계와 물리 계산을 연결하는 신약 연구 플랫폼.
연구 질문에서 후보 비교와 실험 계획까지. 계산이 담당하는 역할과 분야별 연구 역량을 소개합니다.
플랫폼Platform가설에서 검증할 수 있는 계획까지
넓게 탐색하고,
좁혀서 확인합니다.
구조, 분자 물리, AI와 개발 가능성을 같은 판단 과정에 놓습니다. 산출물은 근거와 검증 계획이 있는 가설이지, 이미 작동하는 약물이라는 선언이 아닙니다.
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질문 정의Frame the question
생물학적 근거, 이용 가능한 구조와 RNA 맥락에서 시작합니다. 원하는 기전과 실험이 보여줘야 할 결과를 먼저 정합니다.
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설계와 비교Design & compare
구조 분석·시뮬레이션·물성 검토로 적합한 접근을 비교합니다. 점수 하나가 아니라 연구 질문을 기준으로 후보를 좁힙니다.
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순위의 재검토Challenge the ranking
기준 사례·적용 범위·실행 제약을 확인합니다. 불확실성, 부정적 결과와 유망한 설계가 실패할 이유도 함께 남깁니다.
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실험 인계Prepare the handoff
후보의 근거를 물질 준비안, 판독 지표와 의사결정 기준으로 연결합니다. 실험 결과는 이후 설계 방향을 바꾸는 근거가 됩니다.
INSIDE THE PLATFORM
여러 계산 방법, 추적 가능한 판단.
기술 구조는 계산과 실험 연계 인터페이스를 포함한 13개 모듈로 구성됩니다. 아래에서는 과학적 목적에 따라 묶어 소개하며, 실제 적용 방법은 연구 질문에 맞게 선택합니다.
판단 원칙
보고된 결과가 아니라, 프로젝트에서 판단하는 방식입니다.
- 도킹과 시뮬레이션 결과가 엇갈릴 때
- 더 유리한 점수를 고르지 않습니다. 각 방법이 기준 리간드를 재현하는지, 분자동역학에서 결합 자세가 유지되는지를 먼저 확인하고, 그래도 엇갈리면 불확실성으로 기록해 순위에 반영합니다.
- 후보에서 제외하는 경우
- 방법의 적용 범위를 벗어난 후보, 합성이나 물성 위험이 큰 후보, 기준 사례를 재현하지 못한 모델에만 근거한 후보는 순위에서 뺍니다. 제외한 이유도 함께 남깁니다.
- 신뢰도가 낮을 때 먼저 할 실험
- 판단을 가장 크게 바꿀 수 있으면서 가장 단순한 측정부터 제안합니다. 예를 들어 결합 가설이 불확실하면 SPR·ITC로 결합을 먼저 확인한 뒤 세포 내 분해와 기전 실험으로 넘어갑니다.
구조와 신뢰도출발점이 되는 모델의 한계를 확인합니다.
실험 구조와 예측 구조의 출처·신뢰도를 구분합니다. AlphaFold 기반 구조와 보완적인 구조 예측을 포켓 평가에 활용하되, 모델 간 일치를 실험 구조 검증으로 해석하지 않습니다.
- AlphaFold / UniProt
- RoseTTAFold2
- 포켓 분석
분자 물리와 동역학배치·에너지·모델의 적용 범위를 살핍니다.
분자동역학, 양자화학 파라미터화, 향상된 샘플링, 전환경로·committor 분석은 서로 다른 질문을 다룹니다. 각 방법에 맞는 대조군, 수렴 확인과 적용 범위가 필요합니다.
- ORCA / Psi4
- GROMACS / PLUMED
- PathCV / committor
- OpenFE / RBFE
결합 자세 생성과 비교하나의 점수보다 여러 계산 관점을 비교합니다.
기하·확산 모델이 제안한 결합 자세를 도킹과 에너지 기반 재평가로 비교합니다. 서로 보완하는 계산 단계이며, 결합을 독립적으로 입증한 실험 결과들이 아닙니다.
- EquiBind
- DiffDock
- AutoDock Vina
- MM-GBSA
AI 예측과 분자 제안결합 가설과 개발 가능성을 함께 평가합니다.
그래프 기반 친화도·ADMET 모델과 강화학습을 포함한 신규 분자 제안 방법을 우선순위화에 활용합니다. 관련 대조군, 학습·적용 범위, 후속 실험 요건을 함께 검토합니다.
- GNN
- ADMET
- 신규 분자 설계 / RL
전자 상태의 정밀 계산필요한 과학적 질문에 한정해 사용합니다.
TD-DFT와 EOM-CCSD는 적합한 전자·광물리 질문을 다루는 전문 계산 방법입니다. 모든 약물의 결합력·효능·안전성을 최종 확인하는 보편적 검증법은 아닙니다.
- TD-DFT
- EOM-CCSD
실험 연계와 피드백다음에 측정해야 할 것을 명시합니다.
실험 파트너와 SPR·ITC 같은 결합·열역학 측정 및 적합한 세포 평가를 계획하고, 결과를 원래 가설과 대조합니다. 다음 설계에 결과를 반영하는 것은 지향하는 연구 흐름이며, 완료된 실험 검증을 보고하는 내용이 아닙니다.
- SPR / ITC 계획
- 세포 평가 계획
- 설계 피드백
플랫폼 설명 영상
AI 플랫폼이 하는 일과 하지 않는 일
계산 기반 연구 과정과 후보 우선순위화, 예측과 실험 근거의 차이를 설명합니다.
02 PLATFORM CAPABILITIES
하나의 연구 질문,
여러 가지 접근.
특정 모달리티를 먼저 정하기보다 표적의 생물학, 분자 설계의 실현 가능성, 다음에 필요한 근거를 함께 살펴 접근 방식을 선택합니다.
계산 기반 설계
근접을 설계하고, 분해는 실험으로 확인합니다.
표적 인식, 링커 설계, E3 연결효소 모집을 하나의 설계 흐름으로 검토합니다. 구조적으로 가능한 설계는 후보를 좁히는 근거이지, 단백질 분해능의 입증은 아닙니다.
검토하는 내용
- 표적 결합 부위와 링커 연결 방향의 적합성
- 링커 배치와 삼원복합체 형성 가능성
- 물성·투과성 위험과 분자 설계의 제약
- 계산 연구 산출물
- 구조적 근거와 한계를 담은 후보 설계 가설, 합성·평가를 위한 실험 인계안.
- 실험으로 확인해야 할 것
- 세포 내 분해, 농도에 따른 반응, 선택성과 기전 의존적 활성.
계산 기반 설계
RNA 근거에서 시작해 기전에 맞게 설계합니다.
RNA와 스플라이싱 가설을 검토한 뒤 안티센스 설계 방향을 정합니다. 스플라이싱 조절과 RNA 발현 억제는 기전·화학·실험 판독 기준이 서로 다릅니다.
검토하는 내용
- RNA 근거·전사체 맥락·가닥 방향의 일치 확인
- 접근성과 전사체·유전체 비표적 결합 가능성 검토
- 기전–화학의 적합성과 실험 대조군 설계
- 계산 연구 산출물
- 우선 검토할 서열 설계 가설, 품질 점검 기록과 실험 계획. 실제 서열과 비공개 표적은 공개하지 않습니다.
- 실험으로 확인해야 할 것
- 의도한 RNA·아이소폼 변화, 비표적 효과와 기능 회복. 서열의 적합성만으로 효능을 판단하지 않습니다.
계산 기반 우선순위화
하나의 도킹 점수에 결론을 맡기지 않습니다.
구조 분석, 결합 자세 생성, 분자 시뮬레이션과 물성 예측을 함께 사용하고, 적용 가능한 범위 안에서 후보를 비교합니다.
검토하는 내용
- 결합 포켓 평가·기준 리간드·재도킹 대조
- 도킹·분자동역학·보정된 자유에너지 비교
- ADMET 위험·합성 용이성·신규 분자 생성 가설
- 계산 연구 산출물
- 사용 방법과 기준 사례, 불확실성을 함께 제시한 후보 우선순위. 절대 결합 친화도의 정확한 예측을 의미하지 않습니다.
- 실험으로 확인해야 할 것
- 결합, 생화학적 활성, 세포 효과와 실험적 ADME·안전성 평가.
협력 제안 범위
바이오의약품에 소분자·계산 역량을 더합니다.
항체–약물 접합체의 페이로드·링커 우선순위화와 펩타이드·거대고리 분자의 물성 검토를 협력 주제로 제안합니다. 항체 자산과 실험 개발은 파트너의 영역입니다.
검토하는 내용
- 페이로드 결합 가설과 물리화학적 위험 검토
- 링커 물성·연결 가능성·안정성 가설 비교
- 페이로드와 큰 분자의 투과성·유출 가능성 검토
- 계산 연구 산출물
- 파트너가 정한 페이로드·링커·펩타이드 집합에 대한 한정된 계산 비교. 파일럿 전에 분석 범위와 다른 분자로의 적용 가능성을 합의합니다.
- 실험으로 확인해야 할 것
- 접합, 약물–항체 비율(DAR), 응집, 페이로드 방출, 세포 활성과 주변 세포 효과. 새로운 항체를 설계하는 서비스는 제공하지 않습니다.
탐색적 우선순위화
면역 가설을 고르되, 반응을 단정하지 않습니다.
펩타이드–MHC class I 예측으로 후속 검토할 신생항원 후보를 정리합니다. 결합·제시 예측은 면역반응 가설의 일부일 뿐입니다.
검토하는 내용
- 펩타이드–MHC class I 적합성과 후보 순위
- 기준 사례 비교와 모델 적용 범위
- 후속 실험 선별에 필요한 근거 정리
- 계산 연구 산출물
- 후보 순위의 판단 근거와 예측이 설명할 수 있는 것·없는 것의 구분.
- 실험으로 확인해야 할 것
- 실제 항원 제시, T세포 인식과 기능적 면역반응. 항원 제시 가능성이 면역원성 입증은 아닙니다.